More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3671 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  98.72 
 
 
705 aa  1432    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  100 
 
 
705 aa  1446    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  98.72 
 
 
705 aa  1430    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  41.47 
 
 
719 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 
711 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 
692 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 
694 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 
694 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  37.77 
 
 
694 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  38.83 
 
 
694 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  38.6 
 
 
711 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 
707 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 
712 aa  244  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  27.48 
 
 
687 aa  240  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 
686 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 
685 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 
686 aa  229  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
685 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
685 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 
685 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  29.55 
 
 
685 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 
685 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
685 aa  204  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 
686 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
835 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 
720 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
688 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 
732 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 
690 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
761 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.95 
 
 
715 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
737 aa  120  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
690 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.09 
 
 
776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 
712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
728 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
695 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 
729 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
748 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 
851 aa  114  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 
733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 
729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 
776 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
757 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 
697 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
758 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
853 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 
764 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 
730 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 
743 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 
703 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
713 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 
743 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 
680 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
728 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 
741 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 
733 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
687 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 
713 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 
792 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
750 aa  101  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 
780 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
722 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 
695 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
717 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
763 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
641 aa  98.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
755 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 
700 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
710 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
733 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
734 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
743 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 
758 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 
758 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
732 aa  95.1  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  22.94 
 
 
714 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
684 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
693 aa  94.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 
758 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.45 
 
 
685 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
726 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 
763 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
761 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
718 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
790 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 
729 aa  91.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 
756 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
687 aa  90.9  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 
724 aa  90.9  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
713 aa  90.5  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 
790 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 
777 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
758 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
773 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
730 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
761 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
771 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 
848 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  21.42 
 
 
755 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>