More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0343 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 686 aa  1387    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 685 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 685 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 685 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 686 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  33 
 
 		 685 aa  313  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 685 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 694 aa  276  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 711 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 694 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  29.14 
 
 		 694 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 719 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 711 aa  246  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 694 aa  243  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  28.57 
 
 		 687 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 707 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 705 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 705 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 705 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 686 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 835 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 695 aa  134  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 764 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 730 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 697 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  25.55 
 
 		 785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 744 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 732 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 720 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 687 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 748 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 748 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 732 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 700 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 729 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 802 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  23.48 
 
 		 714 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 802 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 733 aa  110  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 720 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 758 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 729 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 786 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 732 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 762 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 743 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 729 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 713 aa  104  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 733 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 703 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 743 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 795 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 797 aa  100  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 730 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.69 
 
 		 685 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 710 aa  98.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 744 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 728 aa  97.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 771 aa  97.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  24.02 
 
 		 748 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 723 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 737 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 851 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 853 aa  95.1  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 736 aa  94.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 767 aa  94.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  31.82 
 
 		 776 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 753 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 741 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 720 aa  91.3  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 806 aa  91.3  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 780 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 734 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.17 
 
 		 755 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 730 aa  90.5  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 775 aa  90.5  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 737 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 702 aa  89.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  23.73 
 
 		 889 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  22.13 
 
 		 784 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 666 aa  88.2  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 783 aa  87.4  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 769 aa  87.4  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 741 aa  87.4  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 671 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 749 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 712 aa  86.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>