More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2337 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 741 aa  1511    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  45.54 
 
 		 688 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  42.73 
 
 		 649 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 684 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 713 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 713 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.63 
 
 		 755 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 853 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 851 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 761 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 695 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 732 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 730 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 726 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 704 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 711 aa  162  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 700 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 720 aa  160  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 771 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 720 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 733 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 732 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 759 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 763 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 764 aa  154  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 758 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54950  hypothetical protein  28.61 
 
 		 448 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000722946  unclonable  3.2012599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 680 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 687 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 803 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 767 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 731 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 731 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 794 aa  151  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 778 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 766 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 694 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 765 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 769 aa  147  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 777 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.66 
 
 		 715 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 711 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 778 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 777 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 730 aa  144  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 797 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 712 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  23.44 
 
 		 878 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 780 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 795 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 743 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 764 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 785 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 747 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 786 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 719 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 783 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 755 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 873 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 662 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 753 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 774 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 761 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 741 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.04 
 
 		 685 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 776 aa  137  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 695 aa  137  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  26.72 
 
 		 691 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 746 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 758 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 785 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 694 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 777 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 829 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 712 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 790 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 745 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 723 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 797 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 762 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  24.36 
 
 		 694 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 889 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 738 aa  134  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 751 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 713 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 763 aa  133  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 757 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>