More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1343 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 755 aa  1555    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 764 aa  227  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 722 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 695 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 762 aa  204  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 775 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 723 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.31 
 
 		 715 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 751 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 747 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 720 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 737 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 758 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 687 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 778 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 729 aa  180  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 713 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 776 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 732 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 757 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 748 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 761 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 758 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 769 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 795 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 690 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 758 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 761 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 688 aa  174  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 710 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 731 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 743 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 853 aa  173  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 730 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 783 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 690 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 767 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 713 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 776 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 792 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 726 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 777 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 744 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 704 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 778 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 784 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 722 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 743 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 767 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 851 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 755 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 797 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 774 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 744 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 753 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 724 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 743 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 803 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 797 aa  164  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 766 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 771 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 736 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 788 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 783 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 732 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 736 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 783 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 777 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 702 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 744 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 755 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.46 
 
 		 797 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 771 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 710 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 700 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 749 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 773 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 765 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 703 aa  157  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 835 aa  157  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 800 aa  157  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 800 aa  157  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>