More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4852 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4852  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1569    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 836 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 926 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  34.56 
 
 		 786 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 929 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 783 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 783 aa  200  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 786 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 710 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 730 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 725 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 797 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 731 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 764 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 777 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 729 aa  171  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 919 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 765 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 773 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 750 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 790 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 771 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.86 
 
 		 755 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 783 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 774 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 788 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 723 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 744 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 741 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 771 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 749 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 804 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 734 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 771 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 746 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 758 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 743 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 773 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 747 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 779 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 743 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 803 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 736 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 896 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 790 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 741 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 792 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 745 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.29 
 
 		 809 aa  150  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 763 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 797 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 803 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 776 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 720 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 903 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 690 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 755 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 763 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 767 aa  147  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 738 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 780 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 766 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 778 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 730 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 807 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 809 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 759 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 756 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 761 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 787 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 780 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 864 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 769 aa  140  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 773 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 780 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 790 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 690 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 796 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 777 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 722 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 758 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 778 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 774 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>