More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1967 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 929 aa  1837    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  42.88 
 
 		 836 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 926 aa  516  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 786 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4852  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 772 aa  354  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 783 aa  268  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 737 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 809 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 739 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03469  Outer membrane protein  25.52 
 
 		 760 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 775 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.29 
 
 		 755 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 795 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 847 aa  115  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 797 aa  115  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 838 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 971 aa  113  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 771 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 784 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 762 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  21.18 
 
 		 906 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 864 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 780 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 777 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 783 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 761 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 779 aa  106  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 789 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 969 aa  104  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 797 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 794 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 725 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 766 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 746 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 806 aa  101  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 758 aa  101  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  22 
 
 		 776 aa  99.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 765 aa  100  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 734 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 730 aa  99.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 761 aa  98.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 985 aa  98.6  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 763 aa  98.2  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 365 aa  97.8  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 787 aa  97.8  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 723 aa  97.8  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 855 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  24.27 
 
 		 789 aa  96.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 785 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 754 aa  95.9  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 848 aa  95.1  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 804 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 728 aa  95.1  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 809 aa  94.7  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 807 aa  94.7  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 786 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 766 aa  94.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 684 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 757 aa  93.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 747 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 800 aa  92  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 800 aa  92  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 778 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 807 aa  91.3  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 779 aa  91.3  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 832 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 731 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.06 
 
 		 751 aa  90.1  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 770 aa  90.1  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 733 aa  89.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 809 aa  89.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 704 aa  89.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 798 aa  89  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 789 aa  89  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 747 aa  88.2  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 896 aa  88.2  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  24.4 
 
 		 829 aa  88.2  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 729 aa  88.2  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 803 aa  87.8  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 780 aa  87.8  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 835 aa  87.8  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 738 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 778 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  20.7 
 
 		 873 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 755 aa  87.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 773 aa  86.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 779 aa  87  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 733 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 767 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 735 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 817 aa  85.5  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 880 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 796 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 688 aa  85.1  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  23.89 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>