More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3252 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 798 aa  1632    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 676 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 854 aa  294  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 777 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 795 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 775 aa  231  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 780 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 817 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 780 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 790 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 739 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 792 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 765 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 790 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 817 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 704 aa  181  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 784 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 726 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 809 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 903 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 734 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 782 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 787 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 775 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 761 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 		 754 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 783 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 720 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 732 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 756 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 785 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 776 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 779 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 764 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 767 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 789 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 832 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 776 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 784 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 747 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 746 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 717 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 773 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 755 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 825 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 749 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 790 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 737 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 753 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 748 aa  147  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 733 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 735 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 741 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 785 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 856 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 784 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 759 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 767 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 795 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 761 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 764 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 722 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 789 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 806 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 773 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 723 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 794 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 771 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 758 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 743 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.45 
 
 		 789 aa  134  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 733 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 736 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 809 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 743 aa  134  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 780 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 777 aa  134  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 822 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 796 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 730 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 804 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 758 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 745 aa  131  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 738 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 774 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  23.86 
 
 		 797 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 753 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 784 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>