More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03469 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03469  Outer membrane protein  100 
 
 		 760 aa  1547    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 783 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  30.25 
 
 		 786 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 926 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 737 aa  160  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 836 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 743 aa  154  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 747 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 774 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 775 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 764 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4852  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 772 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 771 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  24.46 
 
 		 862 aa  125  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 802 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 777 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  22.48 
 
 		 797 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 929 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 780 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  36.26 
 
 		 809 aa  120  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  23.21 
 
 		 776 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 903 aa  115  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  37.22 
 
 		 775 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 704 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  33.85 
 
 		 739 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 753 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 755 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 758 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 730 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 731 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 810 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 745 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 710 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 782 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 773 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  33.65 
 
 		 797 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  35.35 
 
 		 807 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.96 
 
 		 784 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 720 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 971 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 815 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 896 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 764 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 792 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 756 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 969 aa  103  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 808 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 733 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 777 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 862 aa  101  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 789 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  25.4 
 
 		 906 aa  101  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 729 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 886 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  32.69 
 
 		 759 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 730 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 769 aa  99.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 746 aa  99  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 771 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 778 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 797 aa  98.6  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 794 aa  97.8  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 817 aa  97.8  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 755 aa  97.4  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 743 aa  97.4  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 786 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 796 aa  97.4  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 767 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 765 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 804 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 807 aa  96.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 985 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 824 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 783 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  31.32 
 
 		 751 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 790 aa  95.5  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 783 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 937 aa  95.5  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 795 aa  95.1  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 762 aa  95.1  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 795 aa  95.1  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 803 aa  94.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 741 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 796 aa  94.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 734 aa  94.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 		 839 aa  94.7  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 797 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 851 aa  94.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 856 aa  94  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 763 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 731 aa  94  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 759 aa  93.6  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>