More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2764 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  48.69 
 
 		 731 aa  674    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  70.53 
 
 		 761 aa  1072    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  77.29 
 
 		 763 aa  1173    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 776 aa  1595    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  44.2 
 
 		 758 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  44.83 
 
 		 742 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  42.18 
 
 		 777 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 757 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  38.7 
 
 		 769 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 754 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  40.27 
 
 		 738 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 763 aa  266  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 773 aa  251  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 759 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 747 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 771 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 773 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 773 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 794 aa  214  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 741 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 766 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 725 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 726 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 761 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 695 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.44 
 
 		 755 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 737 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 743 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 730 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 782 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 756 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 767 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 744 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 764 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 764 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 730 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 720 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 739 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 755 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 730 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.61 
 
 		 822 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 758 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 780 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 759 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 779 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 764 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 790 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 797 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 765 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  26.99 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 853 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 778 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 778 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 755 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 761 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 808 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 784 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 785 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 728 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 757 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 800 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 800 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 736 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 726 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 777 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 851 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 710 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 749 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.84 
 
 		 715 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 734 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 803 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 780 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 802 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 804 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 743 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 788 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 722 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 763 aa  165  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 796 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 808 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 785 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 798 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 759 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 814 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 786 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 775 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 777 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 825 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>