More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2110 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 765 aa  1563    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  39.13 
 
 		 850 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 784 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 804 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 759 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 771 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 		 763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 797 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 779 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 728 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 807 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 794 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 780 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 858 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 729 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 728 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 764 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 788 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 761 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 777 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 765 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 776 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 787 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 775 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 759 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 750 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.01 
 
 		 755 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 749 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 792 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 780 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 774 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 803 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 730 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 803 aa  184  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 778 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 775 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 751 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 730 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 745 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 770 aa  180  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 734 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 808 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 761 aa  177  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 751 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 766 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 792 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 733 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 776 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 741 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 757 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 809 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 710 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 780 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 702 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 758 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 761 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.04 
 
 		 739 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 758 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 790 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 731 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 722 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 794 aa  170  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 731 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 767 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.74 
 
 		 715 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 747 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 771 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 786 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 763 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 737 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 724 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 771 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 854 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 758 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 744 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  28.24 
 
 		 738 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  28.05 
 
 		 797 aa  164  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 758 aa  164  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 779 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>