More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02805 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 696 aa  1417    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  48.91 
 
 		 687 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  39.56 
 
 		 726 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  36.68 
 
 		 714 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 713 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 732 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 748 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 757 aa  347  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 729 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 733 aa  340  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 733 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 743 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 744 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 736 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 743 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 730 aa  333  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 729 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 712 aa  333  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 744 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 744 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 697 aa  292  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 728 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 733 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 779 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 704 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 851 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 853 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 718 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 686 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 731 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 753 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 713 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 737 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 771 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 690 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 829 aa  111  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 766 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.6 
 
 		 715 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 730 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 670 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 751 aa  107  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 728 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 761 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 713 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 743 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 695 aa  103  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 780 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 702 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 723 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 796 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 695 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 774 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 687 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 757 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 802 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 797 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 780 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 700 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 762 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 764 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 761 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 761 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 798 aa  98.2  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 710 aa  97.8  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 784 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.96 
 
 		 755 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 765 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 758 aa  94.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2711  TonB-dependent receptor, plug  22.66 
 
 		 762 aa  94  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.882237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 763 aa  94  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 764 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 783 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  23.47 
 
 		 785 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 747 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 767 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 835 aa  90.5  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 710 aa  90.5  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 773 aa  90.5  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 688 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  22.78 
 
 		 694 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 741 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 777 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 741 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 694 aa  89  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 713 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 758 aa  88.2  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 781 aa  87.8  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 771 aa  87.8  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 693 aa  87.4  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 719 aa  87  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 669 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 685 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  21.32 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>