More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3090 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  62.94 
 
 		 704 aa  905    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  100 
 
 		 690 aa  1405    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  55.51 
 
 		 688 aa  779    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  52.31 
 
 		 713 aa  716    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  45.04 
 
 		 675 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  46.25 
 
 		 696 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  45.87 
 
 		 712 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  43.7 
 
 		 703 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  43.7 
 
 		 710 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  43.25 
 
 		 731 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 687 aa  339  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  32.8 
 
 		 774 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 774 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  32.72 
 
 		 782 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 777 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.26 
 
 		 784 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.11 
 
 		 784 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  30.99 
 
 		 717 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 782 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 693 aa  293  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.04 
 
 		 774 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  29.87 
 
 		 731 aa  290  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  31.04 
 
 		 774 aa  290  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  31.04 
 
 		 774 aa  290  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 774 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 774 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 708 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 721 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 807 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 723 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 720 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  30.74 
 
 		 809 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  30.22 
 
 		 784 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 809 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 809 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 809 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 782 aa  158  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 734 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 700 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 731 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 728 aa  111  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.24 
 
 		 705 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 739 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 638 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 730 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  22.45 
 
 		 664 aa  99  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 736 aa  97.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 821 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 653 aa  94.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 813 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  24.89 
 
 		 713 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 738 aa  91.3  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 727 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 751 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  20.97 
 
 		 656 aa  90.5  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 729 aa  90.5  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 700 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 700 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 747 aa  90.5  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 700 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 727 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  23.14 
 
 		 737 aa  88.2  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 700 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  21.54 
 
 		 712 aa  87.4  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 709 aa  87.4  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 700 aa  87.4  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 690 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  30.74 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  30.74 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 700 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  22.32 
 
 		 807 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  30.74 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 681 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  20.58 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 698 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  30.74 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  21.94 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  21.94 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 652 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  21.61 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  30.33 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.22 
 
 		 665 aa  81.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  31.47 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.19 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.31 
 
 		 806 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.21 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  22.93 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.49 
 
 		 710 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 694 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>