More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0508 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 764 aa  1571    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  59.81 
 
 		 773 aa  884    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  39.87 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 738 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 727 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 727 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  35.91 
 
 		 737 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 730 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 729 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 751 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 880 aa  343  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 782 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 700 aa  180  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.17 
 
 		 705 aa  168  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 518 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 684 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 684 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 684 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.33 
 
 		 687 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 683 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 683 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 696 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 684 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  22.34 
 
 		 712 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.63 
 
 		 703 aa  104  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 711 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.5 
 
 		 784 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.42 
 
 		 691 aa  97.8  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.55 
 
 		 683 aa  97.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 683 aa  97.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.86 
 
 		 713 aa  95.9  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 774 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.87 
 
 		 774 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 704 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.01 
 
 		 784 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 777 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.44 
 
 		 782 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 709 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 782 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 809 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 411 aa  87.8  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 411 aa  87.8  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  31.76 
 
 		 690 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 710 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 688 aa  85.9  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 809 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  34.09 
 
 		 774 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  34.09 
 
 		 774 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 774 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.47 
 
 		 809 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  34.09 
 
 		 774 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 809 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 721 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 774 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 708 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  22.72 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.56 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 675 aa  78.2  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 731 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 721 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  35.25 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 693 aa  74.3  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 770 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  20.51 
 
 		 846 aa  68.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.67 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  30.47 
 
 		 731 aa  69.3  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 664 aa  68.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 821 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  29.69 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 731 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.25 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 746 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  27.74 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.35 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.35 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.35 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  25.4 
 
 		 694 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.55 
 
 		 693 aa  65.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.81 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 836 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.14 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.43 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.14 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.14 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>