More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0865 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 700 aa  1431    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  51.78 
 
 		 705 aa  733    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 782 aa  276  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 727 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 675 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  28.2 
 
 		 712 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 729 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 730 aa  170  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  26.74 
 
 		 737 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.84 
 
 		 784 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 773 aa  168  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.41 
 
 		 784 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 734 aa  164  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 738 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 777 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 751 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 688 aa  162  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 687 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  25.38 
 
 		 782 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 693 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 782 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.1 
 
 		 774 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 747 aa  151  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 774 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 696 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 731 aa  145  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 809 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 704 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  24.57 
 
 		 774 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 774 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  24.57 
 
 		 774 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.65 
 
 		 774 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 809 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 709 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 774 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  24.74 
 
 		 809 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 711 aa  135  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 708 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  25.96 
 
 		 717 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 723 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 721 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  24.8 
 
 		 731 aa  127  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 710 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 720 aa  125  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  24.86 
 
 		 690 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 711 aa  124  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.1 
 
 		 713 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 721 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  32.14 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 880 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 705 aa  117  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 821 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 703 aa  111  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 614 aa  110  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  28.3 
 
 		 784 aa  107  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.42 
 
 		 656 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 704 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 736 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 700 aa  100  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 700 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 670 aa  99.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 700 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.43 
 
 		 727 aa  98.2  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 700 aa  98.2  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 739 aa  98.2  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 694 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.96 
 
 		 710 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 778 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.6 
 
 		 700 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 731 aa  96.3  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.26 
 
 		 706 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.6 
 
 		 700 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.15 
 
 		 721 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25 
 
 		 706 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25 
 
 		 706 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.3 
 
 		 706 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 731 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 669 aa  94  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 746 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 728 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 702 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 825 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  22.82 
 
 		 697 aa  91.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 724 aa  91.3  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  22.64 
 
 		 690 aa  91.3  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 825 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 736 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>