More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0818 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
518 aa  1087    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  49.5 
 
 
782 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  33.57 
 
 
774 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
774 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 
777 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
709 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 
693 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  32.06 
 
 
782 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 
782 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 
708 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  32.35 
 
 
774 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  32.35 
 
 
774 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 
704 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.99 
 
 
774 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
774 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 
734 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 
710 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
774 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
711 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 
700 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  27.85 
 
 
705 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 
773 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  28.79 
 
 
717 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  28.09 
 
 
731 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 
727 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 
727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 
687 aa  117  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  29.89 
 
 
712 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  29.82 
 
 
784 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
738 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  29.45 
 
 
784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 
723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 
696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 
731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 
721 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 
730 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  30.6 
 
 
721 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 
688 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 
703 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
809 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  30.94 
 
 
690 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 
720 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 
729 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
675 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  29.17 
 
 
809 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
809 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
809 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
807 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  30.74 
 
 
737 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.39 
 
 
713 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 
880 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  27.61 
 
 
784 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
764 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
747 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 
701 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  30.57 
 
 
696 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 
747 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 
821 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 
680 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  29.38 
 
 
613 aa  74.3  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 
715 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  26.67 
 
 
698 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  25 
 
 
739 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  31.58 
 
 
702 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  35.53 
 
 
846 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
664 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
798 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
749 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  30.27 
 
 
696 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
715 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 
737 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  28.49 
 
 
656 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.99 
 
 
618 aa  71.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 
686 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 
729 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
602 aa  71.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 
741 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 
742 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  32.75 
 
 
707 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 
767 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  31.41 
 
 
807 aa  70.1  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 
755 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
743 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
737 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
678 aa  70.1  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
613 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 
764 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.16 
 
 
645 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
715 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
697 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
714 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  27.03 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 
736 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
778 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.76 
 
 
633 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 
634 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.8 
 
 
631 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
648 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>