More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2308 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  62.75 
 
 
708 aa  885    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
693 aa  1409    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  44.96 
 
 
687 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  43.86 
 
 
717 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  44.62 
 
 
720 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  41.87 
 
 
723 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  42.6 
 
 
731 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  41.14 
 
 
774 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  40.9 
 
 
777 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 
721 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  41.47 
 
 
774 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  41.62 
 
 
774 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  41.47 
 
 
774 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  41.47 
 
 
774 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  41.22 
 
 
721 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  40.69 
 
 
809 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  40.4 
 
 
809 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 
809 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  40.55 
 
 
809 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  40.55 
 
 
774 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  42.28 
 
 
784 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  41.86 
 
 
784 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  41.59 
 
 
782 aa  482  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 
782 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  40.41 
 
 
774 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 
807 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  42.1 
 
 
784 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 
675 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 
696 aa  324  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 
688 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 
703 aa  298  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 
704 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  32.2 
 
 
712 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  32.2 
 
 
690 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
731 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.46 
 
 
713 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 
710 aa  263  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 
711 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
782 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  27.11 
 
 
705 aa  181  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
700 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 
518 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.22 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
727 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
727 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 
709 aa  121  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 
813 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 
664 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 
751 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
730 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
821 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.95 
 
 
690 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
729 aa  111  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  23.42 
 
 
702 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  21.87 
 
 
664 aa  104  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
718 aa  104  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 
615 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.12 
 
 
701 aa  103  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 
747 aa  98.2  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.04 
 
 
666 aa  97.4  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
698 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
688 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  21.44 
 
 
807 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
644 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  25.21 
 
 
737 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
700 aa  94.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  21.61 
 
 
718 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 
798 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
613 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
792 aa  91.3  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 
657 aa  90.9  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 
715 aa  90.5  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
734 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 
706 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
702 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 
795 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 
688 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
773 aa  88.2  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  21.57 
 
 
846 aa  87.8  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
692 aa  87  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 
728 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
638 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.58 
 
 
706 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 
659 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.4 
 
 
706 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 
746 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.98 
 
 
706 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  24.28 
 
 
715 aa  85.1  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.4 
 
 
706 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.08 
 
 
721 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25 
 
 
706 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.25 
 
 
700 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24 
 
 
620 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.54 
 
 
710 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 
656 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 
736 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  24.73 
 
 
680 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
706 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>