More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1853 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  75.92 
 
 		 809 aa  1120    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  75.78 
 
 		 809 aa  1120    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  53.36 
 
 		 687 aa  710    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  74.54 
 
 		 807 aa  1087    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 721 aa  1469    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  54.35 
 
 		 731 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  53.84 
 
 		 717 aa  749    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  52.88 
 
 		 723 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  75.78 
 
 		 809 aa  1119    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  74.93 
 
 		 809 aa  1106    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  95.01 
 
 		 721 aa  1382    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  52.15 
 
 		 720 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  45.99 
 
 		 782 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  46.31 
 
 		 777 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  46.63 
 
 		 782 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  45.53 
 
 		 774 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  45.68 
 
 		 774 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  46.56 
 
 		 774 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  45.53 
 
 		 774 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  45.53 
 
 		 774 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  45.53 
 
 		 774 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  46.45 
 
 		 784 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  46.28 
 
 		 774 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  46.2 
 
 		 784 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  44.76 
 
 		 784 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  40.47 
 
 		 708 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  40.93 
 
 		 693 aa  502  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 675 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 696 aa  316  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 703 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 688 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  30.76 
 
 		 712 aa  295  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 704 aa  289  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 710 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  30.87 
 
 		 690 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.69 
 
 		 713 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 731 aa  243  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 782 aa  196  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 729 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 751 aa  143  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 727 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 738 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 730 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 727 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 518 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 664 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.79 
 
 		 705 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 734 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 747 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.38 
 
 		 737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  25.21 
 
 		 744 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.9 
 
 		 744 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.32 
 
 		 706 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.32 
 
 		 706 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.32 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.18 
 
 		 721 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.32 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  25.03 
 
 		 744 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 657 aa  104  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 709 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.79 
 
 		 746 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.62 
 
 		 690 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.61 
 
 		 701 aa  98.6  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.48 
 
 		 664 aa  98.6  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 773 aa  97.8  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 700 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  23.96 
 
 		 713 aa  95.9  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 675 aa  95.1  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 705 aa  95.1  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  23.01 
 
 		 702 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 700 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 700 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 700 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  22.49 
 
 		 846 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.82 
 
 		 750 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  23.23 
 
 		 718 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 644 aa  92.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 798 aa  92.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 		 659 aa  92  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 700 aa  92  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.19 
 
 		 700 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.19 
 
 		 700 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 821 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 700 aa  89.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 736 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.62 
 
 		 743 aa  89  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  19.94 
 
 		 807 aa  87.8  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.52 
 
 		 716 aa  87.4  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 765 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25.22 
 
 		 760 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  23.65 
 
 		 651 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  22.46 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>