More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02035 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  51.78 
 
 
700 aa  733    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  100 
 
 
705 aa  1436    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 
782 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
727 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
727 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
751 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 
729 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
709 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  29.05 
 
 
737 aa  193  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
730 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
738 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 
693 aa  181  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  26.82 
 
 
712 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 
708 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
734 aa  164  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 
731 aa  164  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
747 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
773 aa  160  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
710 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
675 aa  158  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
703 aa  158  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 
687 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.61 
 
 
774 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 
774 aa  153  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.46 
 
 
774 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.46 
 
 
774 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 
774 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 
777 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.26 
 
 
774 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 
774 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 
809 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.3 
 
 
809 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 
809 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 
809 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 
723 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 
764 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  24.66 
 
 
717 aa  144  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 
782 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.85 
 
 
784 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.74 
 
 
784 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.43 
 
 
782 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 
711 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
880 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
411 aa  138  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
411 aa  138  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 
688 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 
720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 
807 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
821 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  24.32 
 
 
731 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.68 
 
 
784 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 
704 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 
696 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 
518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
721 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.91 
 
 
713 aa  114  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  23.11 
 
 
721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.95 
 
 
857 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.18 
 
 
859 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.61 
 
 
861 aa  106  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
779 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  24.04 
 
 
730 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
670 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 
746 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 
728 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.98 
 
 
711 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 
700 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 
700 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
700 aa  100  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  23.65 
 
 
730 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.32 
 
 
690 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 
708 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
731 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.23 
 
 
721 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 
703 aa  97.8  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 
742 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.15 
 
 
700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 
704 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 
710 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.15 
 
 
700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.19 
 
 
759 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
700 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.31 
 
 
656 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  23.43 
 
 
846 aa  95.5  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.37 
 
 
862 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
700 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 
798 aa  94.4  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
736 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 
710 aa  94  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 
711 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 
700 aa  93.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.9 
 
 
713 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 
728 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  33.49 
 
 
711 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.2 
 
 
706 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
720 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 
724 aa  92.8  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.2 
 
 
706 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  22.41 
 
 
693 aa  91.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>