More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3787 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  89.3 
 
 		 729 aa  1341    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  68.31 
 
 		 727 aa  1033    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  68.59 
 
 		 727 aa  1037    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 751 aa  1551    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  78.81 
 
 		 730 aa  1148    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  67.59 
 
 		 737 aa  997    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  41.2 
 
 		 747 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 738 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  39.56 
 
 		 880 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 734 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 773 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 		 764 aa  392  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28.96 
 
 		 705 aa  213  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 782 aa  208  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.62 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 684 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 684 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 683 aa  177  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 700 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.21 
 
 		 683 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 683 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 683 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 683 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 710 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 721 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 809 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  26.87 
 
 		 809 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 809 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 687 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 809 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 711 aa  137  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 807 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  25 
 
 		 712 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 518 aa  134  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 693 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 709 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.83 
 
 		 774 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  21.75 
 
 		 708 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 731 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.97 
 
 		 774 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 720 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 688 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.39 
 
 		 777 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 696 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.94 
 
 		 774 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.86 
 
 		 784 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 774 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.86 
 
 		 774 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 774 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.86 
 
 		 774 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.7 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 704 aa  107  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 675 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  25.33 
 
 		 690 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 703 aa  92.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.55 
 
 		 713 aa  92  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.78 
 
 		 712 aa  90.5  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 681 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 411 aa  87.4  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 411 aa  87.4  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.74 
 
 		 693 aa  87  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.33 
 
 		 710 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  27.69 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  22.88 
 
 		 715 aa  80.9  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  21.96 
 
 		 815 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  32.23 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.52 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  22.47 
 
 		 821 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.52 
 
 		 784 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 699 aa  77.4  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 820 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  22 
 
 		 820 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  22.16 
 
 		 814 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.51 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 821 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.22 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 823 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  21.14 
 
 		 823 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  22.97 
 
 		 744 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23 
 
 		 714 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.34 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.86 
 
 		 746 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 714 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 813 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.42 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.58 
 
 		 601 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 677 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.21 
 
 		 744 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 727 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>