More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3142 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  52.47 
 
 		 713 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  45.65 
 
 		 710 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  56.16 
 
 		 690 aa  776    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  50.45 
 
 		 712 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  54.67 
 
 		 704 aa  744    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 688 aa  1408    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  45.96 
 
 		 711 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  46.88 
 
 		 703 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  45.02 
 
 		 731 aa  593  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  44.07 
 
 		 675 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  44.92 
 
 		 696 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 687 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  33.48 
 
 		 774 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  33.48 
 
 		 774 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  33.48 
 
 		 774 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 774 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 774 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 708 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  31.35 
 
 		 774 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 774 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 693 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 721 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 807 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 721 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  30.24 
 
 		 717 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 777 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.28 
 
 		 784 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 782 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 809 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 809 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  30.87 
 
 		 784 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  30.04 
 
 		 782 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  30.87 
 
 		 809 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 809 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  30.23 
 
 		 731 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  30.94 
 
 		 784 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 723 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 720 aa  247  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 782 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 700 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.19 
 
 		 705 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 727 aa  128  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 727 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 738 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 698 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 698 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 698 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.16 
 
 		 737 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.46 
 
 		 696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 730 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.32 
 
 		 696 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  24.77 
 
 		 846 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.88 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.29 
 
 		 695 aa  107  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 729 aa  107  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.64 
 
 		 666 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.64 
 
 		 666 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.64 
 
 		 666 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.64 
 
 		 666 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 821 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 731 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 747 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.18 
 
 		 663 aa  101  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.78 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.42 
 
 		 666 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  22.41 
 
 		 807 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 701 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 713 aa  98.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 740 aa  96.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 695 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 730 aa  95.9  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 798 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 664 aa  94.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 734 aa  94.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 858 aa  94  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.68 
 
 		 696 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 696 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 688 aa  90.9  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.91 
 
 		 646 aa  90.5  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 708 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 714 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.95 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 656 aa  89.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 813 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 860 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  22.01 
 
 		 636 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 706 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.04 
 
 		 711 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 739 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 665 aa  88.2  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 701 aa  88.2  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.82 
 
 		 663 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 863 aa  87.8  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 736 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.82 
 
 		 663 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.82 
 
 		 663 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.82 
 
 		 663 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.43 
 
 		 665 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>