More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3399 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  68.18 
 
 		 729 aa  1031    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  68.59 
 
 		 751 aa  1037    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  71.78 
 
 		 737 aa  1037    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  68.46 
 
 		 730 aa  1018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  99.31 
 
 		 727 aa  1502    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 727 aa  1511    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 747 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 880 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 734 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 738 aa  446  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 764 aa  419  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 773 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  27.97 
 
 		 705 aa  220  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 782 aa  204  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 700 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 683 aa  190  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 684 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 684 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 684 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 684 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 683 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 683 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 683 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.44 
 
 		 691 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.46 
 
 		 683 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 721 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 721 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 807 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  24.42 
 
 		 809 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 703 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 809 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 		 518 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 809 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 687 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 731 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 688 aa  134  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 675 aa  134  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 709 aa  134  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 693 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.58 
 
 		 712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 696 aa  130  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 711 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 723 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 720 aa  124  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.19 
 
 		 774 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 774 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 777 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.79 
 
 		 784 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.68 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.68 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.68 
 
 		 774 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 708 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.1 
 
 		 713 aa  114  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  21.41 
 
 		 782 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 704 aa  98.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  26.46 
 
 		 690 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  23.34 
 
 		 715 aa  87.4  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.12 
 
 		 698 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 706 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  29.55 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.7 
 
 		 712 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.28 
 
 		 710 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.99 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 821 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 747 aa  81.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  27.78 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  28.05 
 
 		 693 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  28.41 
 
 		 784 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  27.84 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 749 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  27.55 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.83 
 
 		 760 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  21.05 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  21.05 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 677 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 770 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  23.51 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.18 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  22.28 
 
 		 706 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>