More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0651 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  100 
 
 
656 aa  1337    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  47.9 
 
 
664 aa  609  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  40.09 
 
 
664 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  38.62 
 
 
690 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  36.96 
 
 
718 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  37.65 
 
 
702 aa  405  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.29 
 
 
663 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.79 
 
 
665 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.79 
 
 
665 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.47 
 
 
665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.43 
 
 
666 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 
728 aa  134  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.43 
 
 
666 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.97 
 
 
666 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.97 
 
 
666 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.49 
 
 
721 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.35 
 
 
706 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.35 
 
 
706 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.35 
 
 
706 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.35 
 
 
706 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.42 
 
 
663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  24.54 
 
 
713 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
656 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 
653 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 
652 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 
739 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
700 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 
653 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
653 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 
693 aa  117  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
653 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
653 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 
653 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.69 
 
 
653 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23 
 
 
700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23 
 
 
700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.16 
 
 
666 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 
638 aa  110  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 
653 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 
715 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 
711 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 
680 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
794 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 
675 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  22.39 
 
 
653 aa  104  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
618 aa  104  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.55 
 
 
717 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  24.63 
 
 
656 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 
723 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.22 
 
 
646 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 
652 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  25.33 
 
 
659 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23.72 
 
 
809 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.93 
 
 
713 aa  100  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 
809 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
649 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
704 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 
710 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 
686 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  22.6 
 
 
696 aa  98.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  32.8 
 
 
651 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 
809 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.45 
 
 
712 aa  98.2  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 
743 aa  97.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  19.72 
 
 
705 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 
809 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.04 
 
 
646 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.47 
 
 
647 aa  97.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23 
 
 
702 aa  95.5  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
704 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.73 
 
 
755 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.73 
 
 
755 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  20.56 
 
 
713 aa  95.1  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  24.05 
 
 
698 aa  94.7  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.34 
 
 
757 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 
634 aa  94.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.09 
 
 
784 aa  94.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  38.73 
 
 
655 aa  94  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.81 
 
 
638 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.41 
 
 
784 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
624 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  35 
 
 
665 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 
605 aa  92.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.33 
 
 
618 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 
709 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 
687 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 
720 aa  91.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 
703 aa  91.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.32 
 
 
782 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  34.36 
 
 
697 aa  91.3  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  34 
 
 
652 aa  90.9  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.94 
 
 
784 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>