More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1115 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1451    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 710 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 641 aa  293  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.55 
 
 		 716 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 681 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 699 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.49 
 
 		 646 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 702 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  26.25 
 
 		 652 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  25.4 
 
 		 593 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 657 aa  145  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  25.33 
 
 		 668 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 675 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 648 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.56 
 
 		 680 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.54 
 
 		 686 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 696 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.68 
 
 		 653 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  24.27 
 
 		 640 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  24.42 
 
 		 673 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.48 
 
 		 695 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 826 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 709 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 640 aa  128  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 714 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 642 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 686 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.7 
 
 		 665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.7 
 
 		 665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.7 
 
 		 665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 740 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  22.49 
 
 		 713 aa  118  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 623 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 682 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  24.77 
 
 		 617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  23.13 
 
 		 751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  23.13 
 
 		 751 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  23.13 
 
 		 751 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  23.13 
 
 		 751 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.82 
 
 		 653 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  23.13 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 697 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 668 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.1 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 723 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.16 
 
 		 631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 735 aa  111  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  25.31 
 
 		 652 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 662 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 697 aa  110  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 698 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  23.96 
 
 		 670 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 792 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 711 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 688 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  22.68 
 
 		 746 aa  107  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 701 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  22.61 
 
 		 746 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.13 
 
 		 661 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 724 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  22.48 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  22.48 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  22.48 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.09 
 
 		 614 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  22.48 
 
 		 746 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 694 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 662 aa  105  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  22.48 
 
 		 746 aa  104  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 724 aa  104  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 746 aa  104  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  22.65 
 
 		 783 aa  104  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 638 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  22.48 
 
 		 746 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.73 
 
 		 615 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 643 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.24 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  22.17 
 
 		 750 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  22.91 
 
 		 746 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  22.07 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.89 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.9 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1596  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 366 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.89 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  22.8 
 
 		 678 aa  102  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.04 
 
 		 728 aa  101  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.74 
 
 		 614 aa  101  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23.93 
 
 		 702 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.65 
 
 		 690 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.09 
 
 		 698 aa  100  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.74 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.74 
 
 		 614 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>