More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0815 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 		 653 aa  1334    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  88.67 
 
 		 652 aa  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  91.42 
 
 		 653 aa  1239    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  57.75 
 
 		 646 aa  742    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  68.75 
 
 		 665 aa  932    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  91.88 
 
 		 653 aa  1213    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  58.36 
 
 		 656 aa  775    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  93.26 
 
 		 653 aa  1246    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  93.42 
 
 		 653 aa  1249    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  90.66 
 
 		 653 aa  1193    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  62.59 
 
 		 659 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  67.32 
 
 		 656 aa  906    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  91.27 
 
 		 653 aa  1207    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  93.11 
 
 		 653 aa  1243    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  29.04 
 
 		 713 aa  220  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 704 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 704 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 688 aa  167  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.4 
 
 		 666 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 638 aa  151  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 657 aa  143  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 644 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 664 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 656 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 700 aa  108  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 776 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 700 aa  107  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 825 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 728 aa  105  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 825 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 715 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 650 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 815 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  36.46 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 706 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 748 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 748 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 720 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  38.42 
 
 		 681 aa  100  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  31.88 
 
 		 618 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 720 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 		 795 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 619 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.1 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.1 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 701 aa  98.6  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 633 aa  98.2  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.09 
 
 		 619 aa  98.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.92 
 
 		 710 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 812 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 720 aa  97.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 602 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.21 
 
 		 623 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 678 aa  95.5  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 621 aa  95.1  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 614 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.98 
 
 		 712 aa  94.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 681 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  32.46 
 
 		 627 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 729 aa  94  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 789 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 628 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 703 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 613 aa  92.8  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  30.26 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 675 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 724 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.5 
 
 		 690 aa  91.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 615 aa  91.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 593 aa  90.9  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  22.88 
 
 		 664 aa  90.9  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 641 aa  90.9  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  41.48 
 
 		 751 aa  90.5  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 720 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 720 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 705 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  28.62 
 
 		 731 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 712 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  21.72 
 
 		 716 aa  89.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 715 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  21.73 
 
 		 707 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 616 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  27.36 
 
 		 636 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 713 aa  88.2  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  21.5 
 
 		 715 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 708 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 821 aa  87.4  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 850 aa  87.4  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  22.54 
 
 		 693 aa  87  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 715 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.59 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>