More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01932 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  54.49 
 
 		 690 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 713 aa  1442    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  52.47 
 
 		 688 aa  704    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  46.92 
 
 		 704 aa  625  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  43.83 
 
 		 712 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  41.31 
 
 		 710 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  42.92 
 
 		 675 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  42.17 
 
 		 696 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  41.72 
 
 		 711 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 		 703 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 731 aa  511  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 687 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 774 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  32.01 
 
 		 774 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  31.98 
 
 		 782 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 708 aa  289  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.8 
 
 		 784 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  32.03 
 
 		 774 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  32.03 
 
 		 774 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 782 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 777 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.56 
 
 		 784 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  32.03 
 
 		 774 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 774 aa  283  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 774 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.87 
 
 		 784 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  29.92 
 
 		 731 aa  259  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  29.18 
 
 		 717 aa  258  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 720 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 721 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 721 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 807 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 809 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  27.93 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 809 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 809 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 782 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 700 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 821 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.91 
 
 		 705 aa  114  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 739 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 738 aa  105  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 727 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  27.39 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 727 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 736 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 656 aa  100  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 638 aa  92  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 699 aa  91.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 734 aa  90.5  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 764 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  22.35 
 
 		 807 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 681 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.14 
 
 		 695 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.26 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 798 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 644 aa  85.1  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 709 aa  83.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 751 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 731 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 664 aa  80.9  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 695 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.56 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.56 
 
 		 666 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.56 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  22.97 
 
 		 737 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.34 
 
 		 701 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.74 
 
 		 666 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.39 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 713 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 690 aa  77  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.97 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.83 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  22.36 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 828 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 737 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.65 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 767 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  22.52 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 653 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 749 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  24.06 
 
 		 713 aa  73.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  29.21 
 
 		 677 aa  72  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 707 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 729 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.48 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 624 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.08 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>