More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4310 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 737 aa  1484    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  99.47 
 
 		 749 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  99.2 
 
 		 767 aa  762    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  90.81 
 
 		 729 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  99.19 
 
 		 707 aa  749    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  90.35 
 
 		 741 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  68.88 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  63.24 
 
 		 735 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  56.44 
 
 		 649 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  56.06 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  56.05 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 665 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 651 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 699 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 669 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 678 aa  111  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 668 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.04 
 
 		 653 aa  94  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 659 aa  92.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 656 aa  89.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 654 aa  88.6  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 663 aa  87.8  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.95 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.34 
 
 		 675 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 710 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 675 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  32.52 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 685 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 667 aa  81.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 673 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 703 aa  78.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  29.73 
 
 		 695 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 693 aa  77.8  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 675 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  34.42 
 
 		 636 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.53 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.53 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.53 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  39.62 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 		 617 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.53 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.53 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.53 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 687 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 675 aa  75.1  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.68 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.37 
 
 		 646 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  32.8 
 
 		 682 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.67 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.64 
 
 		 640 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 707 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.63 
 
 		 618 aa  73.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 704 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 727 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.33 
 
 		 656 aa  73.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.48 
 
 		 638 aa  73.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.03 
 
 		 713 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 727 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  30.81 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 746 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  30.81 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  30.81 
 
 		 746 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  30.81 
 
 		 746 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  30.81 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  30.81 
 
 		 746 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  30.81 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 628 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 721 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 706 aa  72  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  30.81 
 
 		 746 aa  72  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 627 aa  72  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 701 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.03 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>