More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0713 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  89.3 
 
 		 751 aa  1342    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  79.57 
 
 		 730 aa  1151    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 729 aa  1509    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  67.9 
 
 		 727 aa  1027    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  68.18 
 
 		 727 aa  1032    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  70.36 
 
 		 737 aa  1013    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 747 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 738 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 773 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  39.05 
 
 		 880 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 734 aa  439  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 764 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28.36 
 
 		 705 aa  210  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 782 aa  196  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 700 aa  185  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 684 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 683 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 684 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 684 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 684 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 683 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.77 
 
 		 691 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 683 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.37 
 
 		 683 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 683 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 721 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 710 aa  142  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.5 
 
 		 809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 809 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 809 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.3 
 
 		 712 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 687 aa  132  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 809 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 711 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.74 
 
 		 518 aa  127  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 693 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 774 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 709 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.16 
 
 		 774 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 807 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 688 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 777 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  21.07 
 
 		 708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.33 
 
 		 782 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 782 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  21.58 
 
 		 704 aa  101  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  26.29 
 
 		 690 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 675 aa  95.1  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 696 aa  94.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.4 
 
 		 712 aa  92  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.01 
 
 		 693 aa  91.3  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 703 aa  90.1  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 681 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  22.42 
 
 		 815 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.94 
 
 		 726 aa  83.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.48 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  33.06 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23 
 
 		 760 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  27.18 
 
 		 731 aa  81.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.97 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 823 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 823 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  23.74 
 
 		 715 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.29 
 
 		 784 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.82 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  30.61 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 706 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  22.72 
 
 		 820 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  21.73 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  24.89 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  24.89 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  26.26 
 
 		 774 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 774 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 705 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 762 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.65 
 
 		 760 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 731 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  26.07 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.73 
 
 		 744 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  24.31 
 
 		 746 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  21.8 
 
 		 680 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  22.67 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  22.62 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 628 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>