29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0939 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  69.4 
 
 		 683 aa  981    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  68.13 
 
 		 684 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  67.98 
 
 		 684 aa  955    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 683 aa  1419    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  68.27 
 
 		 684 aa  957    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  67.11 
 
 		 684 aa  945    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  68.96 
 
 		 683 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  69.11 
 
 		 683 aa  969    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  66.91 
 
 		 683 aa  927    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  38.1 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 727 aa  187  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  25.04 
 
 		 737 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 729 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 751 aa  171  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 730 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 738 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 734 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  23.82 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 880 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 773 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 764 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 747 aa  82  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.39 
 
 		 616 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  29.75 
 
 		 741 aa  47.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 738 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 738 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 652 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1007 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>