More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1482 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  75.49 
 
 		 820 aa  1297    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 815 aa  1670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  74.94 
 
 		 812 aa  1289    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  85.09 
 
 		 820 aa  1450    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  84.96 
 
 		 814 aa  1450    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  73.26 
 
 		 825 aa  1226    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  82.52 
 
 		 821 aa  1421    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  80.22 
 
 		 810 aa  1360    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  50.73 
 
 		 807 aa  803    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  92.59 
 
 		 823 aa  1566    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  92.47 
 
 		 823 aa  1562    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  82.52 
 
 		 821 aa  1420    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  74.57 
 
 		 825 aa  1278    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  77.13 
 
 		 811 aa  1327    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  85.45 
 
 		 820 aa  1454    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  77.25 
 
 		 824 aa  1308    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  93.07 
 
 		 823 aa  1576    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 740 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 737 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 748 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 748 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 738 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 712 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 742 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 742 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  24.36 
 
 		 691 aa  145  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 711 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 707 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 713 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.21 
 
 		 724 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 715 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 724 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 724 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 720 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 720 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 702 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 702 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 720 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 723 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 714 aa  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 708 aa  125  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 712 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.91 
 
 		 713 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  31.84 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 719 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  35.02 
 
 		 699 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 749 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 722 aa  114  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 757 aa  111  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 722 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 708 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 701 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 707 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 767 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 921 aa  108  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 921 aa  108  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 881 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 881 aa  108  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 881 aa  108  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 882 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  37.98 
 
 		 679 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.91 
 
 		 706 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  23.82 
 
 		 753 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 706 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  22.99 
 
 		 697 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 711 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 701 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 815 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 701 aa  104  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 701 aa  104  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 701 aa  104  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 		 710 aa  103  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 796 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 770 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 719 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.04 
 
 		 806 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32.11 
 
 		 689 aa  102  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 		 742 aa  102  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 701 aa  101  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 806 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 710 aa  101  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  21.19 
 
 		 767 aa  101  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 701 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 701 aa  100  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  33.21 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 720 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 762 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 699 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.69 
 
 		 797 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 713 aa  100  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 837 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 721 aa  99.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 719 aa  99.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>