29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0937 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  66.23 
 
 		 684 aa  919    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  69.4 
 
 		 683 aa  981    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  65.94 
 
 		 684 aa  914    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  66.96 
 
 		 684 aa  927    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  91.51 
 
 		 683 aa  1258    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  91.65 
 
 		 683 aa  1260    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  85.07 
 
 		 683 aa  1140    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  66.67 
 
 		 684 aa  919    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 683 aa  1405    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  40.26 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.68 
 
 		 737 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 727 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 730 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 729 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 751 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 734 aa  132  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 880 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 738 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.17 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 773 aa  97.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 747 aa  90.5  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 700 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  23.39 
 
 		 631 aa  45.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  20.89 
 
 		 708 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 665 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 809 aa  44.3  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 730 aa  44.3  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>