33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0935 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  67.25 
 
 		 684 aa  922    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  69.11 
 
 		 683 aa  969    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  67.4 
 
 		 684 aa  929    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  66.52 
 
 		 684 aa  919    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  84.33 
 
 		 683 aa  1125    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  91.51 
 
 		 683 aa  1256    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  99.12 
 
 		 683 aa  1390    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 683 aa  1403    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  66.23 
 
 		 684 aa  913    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  39.22 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  26.33 
 
 		 737 aa  187  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 730 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 727 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 729 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 751 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 880 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.43 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 773 aa  90.9  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 809 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 700 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 730 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 665 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 781 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 777 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 777 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 777 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  23.04 
 
 		 631 aa  43.9  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>