More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0279 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1478    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 757 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 728 aa  145  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 700 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 700 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.99 
 
 		 700 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.99 
 
 		 700 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 700 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 675 aa  131  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 700 aa  127  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.68 
 
 		 706 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.96 
 
 		 721 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.82 
 
 		 706 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.54 
 
 		 706 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.54 
 
 		 706 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 788 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 709 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.87 
 
 		 726 aa  117  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 681 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 706 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 688 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.04 
 
 		 693 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  22.68 
 
 		 670 aa  108  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 626 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 626 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 735 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 776 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 711 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 709 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 702 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  24.97 
 
 		 664 aa  100  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 732 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 761 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.73 
 
 		 755 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 734 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 777 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  22.34 
 
 		 688 aa  95.9  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 705 aa  95.5  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 777 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 777 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.4 
 
 		 712 aa  95.1  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 723 aa  94.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 708 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  21.48 
 
 		 727 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  21.69 
 
 		 703 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 705 aa  92.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 746 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 		 680 aa  91.3  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 724 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 779 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 641 aa  89.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  21.83 
 
 		 710 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 704 aa  89  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 678 aa  88.2  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 710 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 		 659 aa  88.6  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 770 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  22.96 
 
 		 620 aa  88.2  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 714 aa  87.8  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 836 aa  87.4  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  20.52 
 
 		 675 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 720 aa  87  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 705 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 774 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 665 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  24.74 
 
 		 797 aa  85.1  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.54 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 719 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 791 aa  84  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 791 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.21 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  22.57 
 
 		 725 aa  83.2  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 848 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 682 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 671 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.39 
 
 		 691 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.93 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 720 aa  82  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  21.65 
 
 		 758 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 696 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.65 
 
 		 696 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 723 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 769 aa  80.9  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 696 aa  80.5  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 730 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 701 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>