More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0023 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  100 
 
 
747 aa  1503    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  40.8 
 
 
729 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 
727 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 
727 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 
751 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  41.02 
 
 
737 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  39.75 
 
 
730 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 
738 aa  505  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  39.97 
 
 
773 aa  452  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  38.53 
 
 
764 aa  432  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 
734 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  38.11 
 
 
880 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
782 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.77 
 
 
705 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
700 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
709 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 
723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 
687 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 
703 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  22.72 
 
 
712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.45 
 
 
774 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 
807 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.39 
 
 
774 aa  121  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  24.32 
 
 
774 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
774 aa  120  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  24.32 
 
 
774 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 
774 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  24.77 
 
 
717 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
774 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 
710 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 
809 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 
809 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23.39 
 
 
809 aa  114  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 
688 aa  114  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
721 aa  114  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 
684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 
777 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 
711 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 
518 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 
684 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 
693 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 
809 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 
720 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 
684 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.79 
 
 
691 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 
708 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 
696 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
683 aa  107  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  24.73 
 
 
731 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 
782 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 
704 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 
684 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 
675 aa  101  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.86 
 
 
782 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 
683 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
683 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  23.71 
 
 
690 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 
683 aa  94.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.07 
 
 
784 aa  92.8  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 
702 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 
702 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
411 aa  90.9  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
411 aa  90.9  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.93 
 
 
683 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.98 
 
 
713 aa  80.9  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  21.98 
 
 
693 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.22 
 
 
712 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  26.69 
 
 
698 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  30.29 
 
 
784 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.69 
 
 
728 aa  71.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.65 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
821 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 
711 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 
731 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  24.23 
 
 
764 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  22.42 
 
 
744 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.58 
 
 
867 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  22.34 
 
 
744 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 
708 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 
708 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.26 
 
 
764 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  23.57 
 
 
699 aa  65.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
798 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.05 
 
 
744 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.63 
 
 
709 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.68 
 
 
859 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  25.82 
 
 
791 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  20.53 
 
 
846 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.32 
 
 
762 aa  61.6  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  22.08 
 
 
728 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 
695 aa  61.6  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.69 
 
 
760 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.3 
 
 
861 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  21.47 
 
 
708 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.96 
 
 
618 aa  60.1  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.36 
 
 
862 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 
713 aa  59.3  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  25.24 
 
 
807 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 
791 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>