More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0876 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  95.26 
 
 		 760 aa  1500    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  100 
 
 		 760 aa  1563    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  55.37 
 
 		 746 aa  856    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  57.56 
 
 		 747 aa  872    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 815 aa  320  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 782 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.34 
 
 		 766 aa  275  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 828 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 786 aa  231  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 736 aa  210  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 798 aa  208  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 729 aa  202  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 841 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 753 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 796 aa  160  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 768 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 777 aa  154  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 768 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 781 aa  140  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 792 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  24.77 
 
 		 768 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 747 aa  136  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 791 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 780 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 772 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 762 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 777 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 799 aa  120  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 792 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 814 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 786 aa  102  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 781 aa  102  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 754 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 754 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 790 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 735 aa  98.6  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 735 aa  98.6  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 782 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 721 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 765 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 729 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 727 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.86 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  20.46 
 
 		 742 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  22.03 
 
 		 794 aa  72.8  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 768 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 768 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 774 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 731 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.98 
 
 		 713 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.99 
 
 		 774 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 730 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.62 
 
 		 713 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  25.68 
 
 		 673 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  24.73 
 
 		 740 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 712 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 796 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  28.35 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.31 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  28.35 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 757 aa  67.8  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 773 aa  67.4  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 751 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 715 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  25.1 
 
 		 741 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 766 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 796 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  22.97 
 
 		 740 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  25.46 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>