176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2543 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 796 aa  1620    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  45.51 
 
 		 780 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  45.16 
 
 		 768 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 777 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 747 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 792 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 772 aa  230  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 765 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  29.01 
 
 		 768 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 766 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 768 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 738 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 738 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 753 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 777 aa  208  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 815 aa  177  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 791 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 799 aa  172  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.35 
 
 		 760 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.69 
 
 		 760 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 747 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 782 aa  150  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 798 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 746 aa  134  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 814 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 828 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 729 aa  108  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 835 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.23 
 
 		 766 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 781 aa  98.6  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 790 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  22.41 
 
 		 734 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 762 aa  94  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 781 aa  93.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 808 aa  88.2  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 736 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 786 aa  84.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  21.7 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 833 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 792 aa  76.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 841 aa  74.7  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 742 aa  70.9  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 786 aa  67  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 756 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  26.58 
 
 		 740 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 790 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 772 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  24.77 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.3 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  26.04 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  24.46 
 
 		 765 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 710 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 742 aa  56.6  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 721 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  24 
 
 		 740 aa  55.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 782 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 782 aa  55.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 840 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 678 aa  54.7  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 615 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 698 aa  53.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 821 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 684 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  26.86 
 
 		 398 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  26.86 
 
 		 398 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 740 aa  52  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 728 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 607 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 799 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 750 aa  51.6  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 709 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 754 aa  51.6  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 754 aa  51.6  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 707 aa  51.2  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.740421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 824 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 808 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 709 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 649 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 864 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  23.05 
 
 		 730 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 768 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 768 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 702 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  20.53 
 
 		 700 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 755 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>