199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1484 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1592    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  55.42 
 
 		 772 aa  806    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  44.22 
 
 		 765 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  41.12 
 
 		 747 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 768 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  39.42 
 
 		 768 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 738 aa  446  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 738 aa  446  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 777 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 792 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 753 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 766 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 799 aa  303  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 814 aa  266  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 796 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 835 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 768 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 780 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 772 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 786 aa  155  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 762 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 798 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 791 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.54 
 
 		 760 aa  124  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 815 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 792 aa  111  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 841 aa  108  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 786 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 828 aa  92.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 736 aa  88.2  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 790 aa  87.8  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 747 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.02 
 
 		 766 aa  81.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  23.01 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 746 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 781 aa  79.7  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  29.32 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 754 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 754 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 285 aa  73.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  25 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 768 aa  67  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 768 aa  67  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 742 aa  60.8  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  27.98 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 769 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 793 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  23.26 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 795 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 707 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 745 aa  55.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  30.06 
 
 		 730 aa  55.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 720 aa  55.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.87 
 
 		 737 aa  55.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 700 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 742 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  26.56 
 
 		 794 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 727 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 736 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 738 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 738 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 756 aa  55.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 771 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 701 aa  54.3  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  30.87 
 
 		 752 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 742 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  30.87 
 
 		 719 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  30.87 
 
 		 719 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 799 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  24.48 
 
 		 711 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  30.87 
 
 		 747 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 779 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 755 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 656 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 791 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 684 aa  52  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 662 aa  52  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 730 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 777 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 683 aa  51.6  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 769 aa  51.2  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.86 
 
 		 797 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  20.33 
 
 		 765 aa  50.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 729 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 771 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>