More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0907 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  60.58 
 
 		 704 aa  826    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  51.84 
 
 		 705 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 712 aa  1442    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  50.88 
 
 		 707 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  58.7 
 
 		 689 aa  817    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  51.26 
 
 		 707 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  46.32 
 
 		 755 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 708 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  44.78 
 
 		 758 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  43.5 
 
 		 776 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  44.05 
 
 		 718 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  43.99 
 
 		 738 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 739 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  44.14 
 
 		 705 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  42.98 
 
 		 746 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  43.8 
 
 		 720 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  43.15 
 
 		 690 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  42.33 
 
 		 708 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 728 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 742 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.61 
 
 		 747 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.76 
 
 		 770 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 		 727 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  43.31 
 
 		 747 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  40.65 
 
 		 723 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 747 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  42.94 
 
 		 696 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  40.69 
 
 		 822 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.75 
 
 		 820 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  41.61 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.46 
 
 		 756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  41.61 
 
 		 756 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 		 756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 		 756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  41.61 
 
 		 756 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  41.14 
 
 		 701 aa  475  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  41.96 
 
 		 721 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  37.92 
 
 		 703 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  39.06 
 
 		 703 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 720 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  33.56 
 
 		 730 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  33.42 
 
 		 730 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 716 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 717 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 710 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 728 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 717 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 721 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 779 aa  300  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 749 aa  296  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  31.67 
 
 		 784 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 724 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 726 aa  283  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 735 aa  277  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 737 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.21 
 
 		 813 aa  230  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.69 
 
 		 797 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.15 
 
 		 601 aa  210  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 792 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 829 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 770 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 710 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 710 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 719 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  31.52 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 712 aa  180  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 779 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 710 aa  177  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 399 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 742 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 776 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 706 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 706 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 742 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 831 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 799 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 730 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 737 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 708 aa  168  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 748 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 748 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 749 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 740 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.09 
 
 		 833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  27.84 
 
 		 728 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 812 aa  161  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 864 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 705 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 711 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 748 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 718 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  24.5 
 
 		 729 aa  157  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 793 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 719 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  27.51 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 862 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>