73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0369 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 782 aa  1605    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 754 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 754 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  32.13 
 
 		 741 aa  353  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  31.86 
 
 		 740 aa  347  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 756 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  30.69 
 
 		 730 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  30.97 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 786 aa  320  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 790 aa  317  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  30.62 
 
 		 740 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  52.19 
 
 		 285 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 742 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  35.84 
 
 		 398 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  35.84 
 
 		 398 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 736 aa  135  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.26 
 
 		 768 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 768 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 815 aa  79.7  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 777 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 841 aa  70.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 738 aa  70.5  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 738 aa  70.5  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 753 aa  67.4  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 747 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 828 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 777 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 644 aa  57.4  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 799 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 766 aa  54.3  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25 
 
 		 760 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 760 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 782 aa  50.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 798 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23 
 
 		 797 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  31.62 
 
 		 699 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 709 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  21.77 
 
 		 781 aa  49.3  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  22.3 
 
 		 694 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.6 
 
 		 766 aa  48.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 768 aa  48.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  31.37 
 
 		 647 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 763 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 833 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 781 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 760 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  20.43 
 
 		 712 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 697 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  24.21 
 
 		 724 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 765 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 741 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.42 
 
 		 715 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 694 aa  45.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 791 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 649 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 792 aa  45.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 736 aa  44.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 696 aa  44.3  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 781 aa  44.3  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 808 aa  44.3  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 651 aa  44.3  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 694 aa  44.3  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 715 aa  43.9  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>