More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2662 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 781 aa  1597    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  44.69 
 
 		 773 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  43.49 
 
 		 779 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  41.21 
 
 		 741 aa  555  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 778 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 769 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 		 788 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 741 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 822 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 760 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 824 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 841 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 839 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 777 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 777 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 777 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 801 aa  350  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 802 aa  348  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 826 aa  340  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 825 aa  337  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 825 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 821 aa  336  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  30.98 
 
 		 787 aa  336  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 825 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 856 aa  334  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 805 aa  332  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 873 aa  331  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  30.07 
 
 		 797 aa  326  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 775 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 873 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 770 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 848 aa  325  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 868 aa  316  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 821 aa  312  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  29.29 
 
 		 935 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 807 aa  301  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 813 aa  294  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  41.83 
 
 		 1188 aa  209  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  47.5 
 
 		 317 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  23.9 
 
 		 775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 715 aa  112  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 728 aa  97.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 700 aa  94  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 700 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 700 aa  90.9  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.82 
 
 		 706 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.82 
 
 		 706 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.53 
 
 		 706 aa  88.6  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.82 
 
 		 706 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.82 
 
 		 721 aa  88.2  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 700 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 730 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  27.12 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  27.12 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 731 aa  80.9  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  21.26 
 
 		 710 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  28.57 
 
 		 697 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.73 
 
 		 695 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  20.74 
 
 		 675 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  26.21 
 
 		 725 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 697 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 764 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.23 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 786 aa  71.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 706 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.73 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25.08 
 
 		 743 aa  70.1  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 		 708 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.88 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 762 aa  68.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  25.69 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 836 aa  68.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.36 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  20.5 
 
 		 702 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 652 aa  67.4  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 800 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.73 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.02 
 
 		 724 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>