More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0485 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 702 aa  1456    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  69.96 
 
 		 705 aa  1019    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 711 aa  301  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 705 aa  283  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  26.94 
 
 		 725 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 735 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  26.75 
 
 		 670 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 702 aa  206  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 708 aa  203  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 781 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 684 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 757 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1896  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.13 
 
 		 687 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.16 
 
 		 701 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 698 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.3 
 
 		 721 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.3 
 
 		 706 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.3 
 
 		 706 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.15 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.01 
 
 		 706 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 728 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  22.35 
 
 		 713 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 730 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 700 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 688 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 700 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 700 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  21.92 
 
 		 710 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  22.46 
 
 		 700 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 703 aa  97.4  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  22.46 
 
 		 700 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 681 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 678 aa  96.3  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 700 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.55 
 
 		 666 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 779 aa  94  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 706 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 731 aa  92  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.47 
 
 		 666 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 656 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.34 
 
 		 666 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.98 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 687 aa  89  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.71 
 
 		 641 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 656 aa  87  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.7 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.2 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.24 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 736 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 693 aa  84.3  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 707 aa  84  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 688 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.4 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 742 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.26 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.04 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.4 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 696 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.4 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.26 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.26 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.12 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 743 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 749 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 777 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 661 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 692 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  20.46 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 715 aa  80.5  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  21.58 
 
 		 705 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 740 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 670 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  28.88 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.27 
 
 		 706 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.78 
 
 		 862 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 798 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.46 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  19.93 
 
 		 680 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.08 
 
 		 861 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  21.69 
 
 		 690 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>