297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5422 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 770 aa  1550    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  44.49 
 
 		 813 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  40.29 
 
 		 787 aa  545  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 741 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 769 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 822 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 778 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 777 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 788 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 801 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  30.92 
 
 		 935 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 772 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 824 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 779 aa  324  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 781 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 773 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  29.37 
 
 		 741 aa  320  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 839 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 841 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 760 aa  308  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 839 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  30.59 
 
 		 797 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 802 aa  300  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 805 aa  297  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 775 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 825 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 826 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 821 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 807 aa  273  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 825 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 825 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 848 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 856 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 821 aa  258  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 868 aa  220  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 1188 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 873 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 873 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  39.08 
 
 		 317 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  25 
 
 		 775 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 723 aa  97.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 705 aa  84.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.2 
 
 		 700 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.2 
 
 		 700 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.85 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 731 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.66 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.48 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.48 
 
 		 706 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.48 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  21.94 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.44 
 
 		 712 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 694 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 740 aa  72  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 720 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.12 
 
 		 611 aa  64.3  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.4 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 711 aa  62.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.38 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 656 aa  62  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 742 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 611 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 742 aa  58.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.62 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  24.76 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 711 aa  57  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 684 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 821 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 702 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 702 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  23.98 
 
 		 739 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 723 aa  55.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 723 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>