More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3599 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 822 aa  1674    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  44.48 
 
 		 778 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  44.1 
 
 		 769 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  43.42 
 
 		 741 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 777 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 777 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 777 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 		 788 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 873 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 873 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  36.78 
 
 		 741 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  35.35 
 
 		 787 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 770 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  35.16 
 
 		 935 aa  436  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 824 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 773 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 779 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 841 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 839 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  34.48 
 
 		 797 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 839 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 813 aa  399  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 781 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 805 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 848 aa  366  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 772 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 775 aa  366  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 868 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 856 aa  360  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 760 aa  349  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 802 aa  348  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 825 aa  336  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 826 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 825 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 825 aa  327  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 821 aa  326  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 807 aa  290  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 801 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  47.54 
 
 		 1188 aa  265  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  25.97 
 
 		 775 aa  187  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  50 
 
 		 317 aa  185  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.74 
 
 		 712 aa  97.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.49 
 
 		 710 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 757 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 706 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 709 aa  83.2  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 688 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 742 aa  82.8  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 697 aa  82.8  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 720 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.38 
 
 		 743 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 711 aa  70.1  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  28.36 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  28.36 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  28.36 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  28.36 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  28.36 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  22.01 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 724 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 723 aa  64.7  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 694 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 700 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  26.32 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  26.32 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 678 aa  62  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 743 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 840 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 825 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 766 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>