159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2037 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 821 aa  1659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  38.97 
 
 		 775 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 839 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  36.92 
 
 		 797 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 839 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 841 aa  465  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 824 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 805 aa  446  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 848 aa  429  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 825 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 856 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 825 aa  422  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 826 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 821 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 802 aa  416  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 807 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 772 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 825 aa  406  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 868 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 760 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  32.24 
 
 		 741 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 788 aa  336  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 778 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 777 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 777 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 777 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 781 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 769 aa  314  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 741 aa  312  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 779 aa  310  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 801 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 822 aa  303  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 773 aa  293  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 873 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 873 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 770 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 813 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  28.04 
 
 		 787 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  26.04 
 
 		 935 aa  239  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.2 
 
 		 775 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1188 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  34.56 
 
 		 317 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 761 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.7 
 
 		 710 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  20.79 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  21.4 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 720 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  39.33 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  39.33 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 792 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 		 726 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 704 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  25.09 
 
 		 779 aa  55.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.32 
 
 		 859 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 821 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 786 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 694 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 686 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 742 aa  55.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 814 aa  54.7  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 711 aa  54.7  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 787 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  23.88 
 
 		 730 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.68 
 
 		 653 aa  54.3  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 681 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  21.61 
 
 		 749 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 675 aa  54.3  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 864 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.45 
 
 		 861 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 703 aa  53.5  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 766 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 728 aa  52.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 760 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.72 
 
 		 857 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.71 
 
 		 862 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 533 aa  51.6  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 667 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  27.17 
 
 		 683 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.89 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 681 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.71 
 
 		 759 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  21.49 
 
 		 705 aa  50.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 785 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  21.92 
 
 		 705 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 683 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 714 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 735 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 800 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 840 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  26.19 
 
 		 693 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 688 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.29 
 
 		 862 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>