More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0305 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  46.61 
 
 		 825 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  50.57 
 
 		 807 aa  793    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 805 aa  1645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  46.61 
 
 		 825 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  45.15 
 
 		 825 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  46.11 
 
 		 856 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  47.23 
 
 		 821 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  45.47 
 
 		 826 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  50.78 
 
 		 824 aa  812    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  45.05 
 
 		 848 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  47.57 
 
 		 868 aa  670    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  61.29 
 
 		 802 aa  984    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  42.21 
 
 		 797 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 839 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 841 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 839 aa  489  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 775 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 821 aa  429  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 772 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  33.67 
 
 		 741 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 769 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 741 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 822 aa  365  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 777 aa  357  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 777 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 777 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 801 aa  349  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 788 aa  349  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 781 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 778 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 773 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 779 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 813 aa  301  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 770 aa  297  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  30.31 
 
 		 787 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  27.06 
 
 		 935 aa  260  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  26.83 
 
 		 775 aa  237  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 873 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 873 aa  168  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1188 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  37.17 
 
 		 317 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 747 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 747 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 747 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  21.47 
 
 		 727 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  25.15 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 748 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  24.85 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 705 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 766 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.88 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 724 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.88 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.88 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.88 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.88 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.86 
 
 		 716 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  26.59 
 
 		 697 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 728 aa  60.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 790 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 694 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 675 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  27 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  19.98 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 749 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.83 
 
 		 691 aa  58.2  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 734 aa  58.2  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.6 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  26.56 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  26.56 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  25.65 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  22.72 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 803 aa  57.4  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>