More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2804 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  100 
 
 		 692 aa  1386    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  41.8 
 
 		 716 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 704 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 704 aa  206  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 733 aa  193  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 678 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 686 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  24.09 
 
 		 683 aa  110  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 681 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 709 aa  107  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 734 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 683 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.75 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 623 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 748 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 757 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 688 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 687 aa  101  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  24.47 
 
 		 765 aa  100  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  25.14 
 
 		 686 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 705 aa  99.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 678 aa  99  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 694 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 706 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 675 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 736 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 667 aa  95.1  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 681 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.89 
 
 		 666 aa  94  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 678 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 706 aa  91.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 720 aa  90.1  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 701 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 710 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 681 aa  87.8  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  22.41 
 
 		 693 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  27.11 
 
 		 691 aa  87  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 689 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 676 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  23.94 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  23.73 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.39 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  24.96 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.95 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 678 aa  84  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.83 
 
 		 663 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 688 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 683 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 750 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.63 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 760 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.43 
 
 		 712 aa  80.5  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.57 
 
 		 665 aa  80.5  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  37.57 
 
 		 628 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 686 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 681 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 634 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  23.94 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.37 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.04 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 717 aa  75.1  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.26 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.26 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.26 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.26 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.26 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.26 
 
 		 659 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.72 
 
 		 659 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  32.66 
 
 		 706 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  32.66 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  33.2 
 
 		 721 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  33.2 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  32.66 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  23.17 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 679 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  35.29 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  40.41 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  31.22 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.1 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.44 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 712 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>