More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04680 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1548    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  45.67 
 
 		 750 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  53.46 
 
 		 736 aa  838    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  46.97 
 
 		 760 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  51.54 
 
 		 734 aa  751    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  43.09 
 
 		 748 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 676 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 723 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  33.33 
 
 		 765 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  34.46 
 
 		 722 aa  328  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 740 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 718 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 689 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  31.95 
 
 		 699 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 678 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  32.29 
 
 		 692 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 692 aa  300  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  34.11 
 
 		 686 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 712 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 672 aa  293  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  29.38 
 
 		 765 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 689 aa  277  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 705 aa  270  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 717 aa  261  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 678 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 704 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 704 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 733 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.8 
 
 		 692 aa  101  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.75 
 
 		 716 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  21.62 
 
 		 693 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  21.88 
 
 		 683 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 703 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 675 aa  65.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  23.82 
 
 		 942 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  21.2 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  21.17 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1072 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1059 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1034 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 1105 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 874 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  21.15 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1094 aa  58.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1008 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.77 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  21.7 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1038 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 887 aa  57.4  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.78 
 
 		 616 aa  57.4  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  19.62 
 
 		 693 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.25 
 
 		 614 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 686 aa  57.4  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.71 
 
 		 1023 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  26.05 
 
 		 1071 aa  56.6  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.75 
 
 		 630 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.92 
 
 		 646 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1166 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.56 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1004 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 735 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.14 
 
 		 713 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 1023 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  21.12 
 
 		 914 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 720 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 678 aa  55.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 634 aa  55.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 1119 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1093 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1078 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.25 
 
 		 614 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 614 aa  54.3  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  21.03 
 
 		 731 aa  54.3  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 616 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1172 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1059 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.41 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 1140 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.41 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.2 
 
 		 623 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.93 
 
 		 631 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.41 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25 
 
 		 619 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.41 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1011 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  24.62 
 
 		 965 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 1083 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 1082 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  21.4 
 
 		 1128 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1011 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>