66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2872 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  49.33 
 
 		 765 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 676 aa  1384    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  46.98 
 
 		 722 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  47.09 
 
 		 689 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  44.53 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  46.06 
 
 		 723 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  45.4 
 
 		 672 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  45.24 
 
 		 718 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  46.02 
 
 		 712 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  44.31 
 
 		 740 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  44.29 
 
 		 689 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  44.51 
 
 		 699 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  41.55 
 
 		 765 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  42.49 
 
 		 692 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  42.21 
 
 		 692 aa  492  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  39.61 
 
 		 717 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 678 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  40.87 
 
 		 686 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 678 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 736 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 757 aa  340  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 760 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 734 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 748 aa  326  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 750 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 733 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.1 
 
 		 692 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  22.22 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 736 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.83 
 
 		 616 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 617 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 681 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 687 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.76 
 
 		 628 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 689 aa  52  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  20.98 
 
 		 693 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.75 
 
 		 619 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 738 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 686 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 732 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.28 
 
 		 1023 aa  47.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 714 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 623 aa  47.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.83 
 
 		 638 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  22.72 
 
 		 683 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.86 
 
 		 708 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  31.58 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 642 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.29 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  20.1 
 
 		 756 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  20 
 
 		 755 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 616 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.74 
 
 		 618 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 725 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  24.15 
 
 		 762 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  21.52 
 
 		 734 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  28.42 
 
 		 671 aa  44.3  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 671 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 689 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 762 aa  43.9  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 694 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>