79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1233 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  50.6 
 
 		 722 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1459    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  48.95 
 
 		 689 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  50.08 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  49.3 
 
 		 672 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  49.46 
 
 		 712 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  49.84 
 
 		 740 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  50.16 
 
 		 718 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  48.68 
 
 		 699 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  49.3 
 
 		 689 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  44.53 
 
 		 676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  43.17 
 
 		 765 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  40.67 
 
 		 765 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  39.97 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 		 678 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  41.08 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  40.76 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  41.73 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 678 aa  337  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 760 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 734 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 736 aa  293  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 750 aa  273  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 757 aa  270  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  30.38 
 
 		 748 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 733 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 704 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 704 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.54 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  20.98 
 
 		 693 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 683 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  21.13 
 
 		 683 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 686 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 689 aa  52  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.19 
 
 		 696 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 771 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 696 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 850 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  21.25 
 
 		 709 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 700 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 742 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 701 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 689 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 707 aa  47.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.05 
 
 		 706 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 681 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 700 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 662 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 656 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.85 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  22.79 
 
 		 716 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.08 
 
 		 703 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.55 
 
 		 721 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 749 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.55 
 
 		 706 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01786  putative TonB dependent receptor  25.95 
 
 		 779 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 700 aa  45.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.55 
 
 		 706 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.6 
 
 		 1023 aa  44.3  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 729 aa  44.3  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 689 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 689 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 704 aa  43.9  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 715 aa  44.3  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 733 aa  44.3  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.6 
 
 		 700 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 734 aa  43.9  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.6 
 
 		 700 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>