More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1720 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  46.97 
 
 		 757 aa  668    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  46.62 
 
 		 750 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  49.14 
 
 		 736 aa  712    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 760 aa  1564    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  50.69 
 
 		 734 aa  708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  46.54 
 
 		 748 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 723 aa  340  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 672 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 676 aa  337  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 689 aa  333  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  33.38 
 
 		 722 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 740 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  32.57 
 
 		 699 aa  320  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 718 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 678 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  34.4 
 
 		 686 aa  315  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  31.01 
 
 		 692 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  30.1 
 
 		 765 aa  301  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 689 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  30.34 
 
 		 765 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 717 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 733 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 704 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 704 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 687 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.7 
 
 		 692 aa  81.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  22.79 
 
 		 716 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1004 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 793 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 833 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 958 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 748 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 962 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  30.26 
 
 		 827 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 938 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 945 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 866 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 772 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  20.52 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.46 
 
 		 803 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  23.75 
 
 		 914 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1066 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.83 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 854 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 		 1095 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 936 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 997 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1008 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 791 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1062 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 942 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 931 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  20.82 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 1089 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  21.24 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.59 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 957 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 772 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  20.43 
 
 		 681 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 804 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 893 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 763 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1059 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 749 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 1001 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 805 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 		 788 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 707 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 902 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 707 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 791 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 707 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1057 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 742 aa  54.7  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 943 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 924 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 710 aa  54.3  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 1087 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  21.44 
 
 		 795 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 971 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 816 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  20.2 
 
 		 678 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 797 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  24.14 
 
 		 782 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.08 
 
 		 1047 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>