More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5636 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  50.19 
 
 		 791 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  57.14 
 
 		 815 aa  902    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  46.14 
 
 		 833 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 793 aa  1609    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  48.01 
 
 		 716 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  41.17 
 
 		 803 aa  593  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  43.08 
 
 		 794 aa  575  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 720 aa  459  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 691 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.97 
 
 		 942 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 854 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 958 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  29.22 
 
 		 914 aa  111  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 747 aa  97.4  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  28.46 
 
 		 871 aa  94  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 798 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.73 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 780 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  30.74 
 
 		 758 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 988 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 760 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 		 788 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  30.35 
 
 		 758 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 836 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  30.35 
 
 		 758 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.06 
 
 		 800 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.06 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1101 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 918 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 958 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 760 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 955 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 758 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 897 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 828 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1001 aa  70.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 962 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 946 aa  70.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1107 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 776 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 929 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 735 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 979 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  24.77 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 919 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 927 aa  67.4  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  28.63 
 
 		 767 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1020 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 800 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  31.77 
 
 		 979 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 972 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1094 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 1075 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.21 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  19.58 
 
 		 702 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1041 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 812 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 748 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1049 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1021 aa  65.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 1004 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1014 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 943 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 989 aa  65.1  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 933 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1052 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 854 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1130 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 758 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 772 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1083 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  24.03 
 
 		 782 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 775 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 597 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 975 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 874 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1074 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  25.52 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1020 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1059 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1120 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 1011 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  20.23 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1130 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 986 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 769 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>